MTDLKA--SSLRALKLMDLTTLND--------DDTDE--------------K-VIAL--CHQAKTPVGNTAAICIYP---R---FIPI-ARKTL
MTDL--FFSSLRALKLMDLTTLNDSIVTHNRKDDTDEWPFWQKSRDGKYSNKM-IALVFCHQAKTPVGNTAAICIYPCAFRECTFIPIN-RKTL
****----****************--------*****--------------*--***--******************---*---****--****
W = M - X - G = 56 - 38 - 0 = 18
Вес выравнивания можно увеличить, если везде (если это возможно) заменить две позиции с гэпом
на одно совпадение. Таких возможностей 4, вес будет 22.
Комментарий: аминокислота K в позиции 52 может стоять и в позициях 43 и 48.