На главную страницу второго семестра

Доменная структура белка DEOC_ECOLI.

Схематическое изображение доменной структуры	Домены, отмеченные на пространственной структуре белка DEOC_AERPE*

  *Примечание: нет PDB-структуры для домена из E.coli, поэтому взята PDB-структура для Aeropyrum pernix (Unique tetrameric structure of deoxyribose phosphate aldolase from aeropyrum pernix, код 1N7K).

Идентификатор Pfam	Название записи	Полное название домена	Положение в последовательности DEOC_ECOLI
PF01791	DeoC	DeoC/LacD family aldolase (альдолаза из семейства DeoC/LacD)	10-246 (внутри имеется два участка низкой сложности: 14-26 и 237-248)

1. Описание доменов данного семейства: семейство содержит фермент DERA (дезоксирибозофосфатальдолазу), участвующий в метаболизме нуклеотидов, а также группу схожих бактериальных белков с неизвестными функциями;
2. Всего белков с доменом deoC известно 396 штук;
3. Они распределены по таксонам следующим образом:
   
   

   Таксон		Количество белков с доменом PF01791.
   Эукариоты	Растения	0
   	Грибы	5
   	Животные	Metazoa - 15, Protista - 15
   Бактерии		318
   Археи		43

4. Ответы на вопросы:
   • В подавляющем большинстве случаев (394 из 396) домен deoC - единственный домен в белке.
   • Случаев дупликации домена не известно.
   • В двух из 396 случаях домен deoC находится на втором месте в белках, состоящих из двух доменов.

©Хайруллин Альберт