Выбор организма

Я выбрала бактерию Thermus thermophilus, так как она является модельным организмом и довольно хорошо изучена. Эта бактерия используется в генной инженерии, структурной биологии, а так же для изучения некоторых митохондриальных комплексов.

Я вызяла для сравнения Thermus thermophilius N-1 и Thermus thermophilius HB27, обе записи были в RefSeq, качество сборок- Complete genome.

Dot Plot: megablast

Dot Plot: blastn

Что видно на Dot Plot?

На карте megablast слева виден большой участок с инверсией и делециями, а справа несколько делеций. Если сравнить с blastn, то видно, что две делеции исчезли.