Нуклеотидные банки данных

Я выбрала бенгальского макака, одного из самых растространенных мартышек. У них очень широкий ареал обитания, второй после людей среди млекопитающих. Этих обезъянок так же называют макак-резусами в честь фракийского царя Реса, сражавшегося на стороне Трои во время Троянской войны. Для индейцев эти макаки считаются священными и они оставляют часть урожая на полях для них.

источник источник источник

У макака 42 хромосом.

Описание генома

Запрос: Macaca mulatta

Найденно сборок: 13

Уровень сборки: Chromosome (последовательность одной или нескольких хромосом, можеть быть полностью секвенированна или с гэпами.

Сборка референсная (отобранная вручную как наилучшая).

GenBank	RefSeq	Размер генома	Scaffold N50	Scaffold L50	Contig N50	Contig L50
GCA_0033397 65.3	GCF_0033397 65.1	2,971 Mb	82.3 Mb	14	46.6 Mb	22

Поясненения:

Contig N50 это размер минимального контига, в котором содержится 50% нуклеотидов сборки.

Contig L50 это число контигов, суммарная длина которых не менее 50% от сборки.

Скачивание файлов

GCF_003339765.1_Mmul_10_genomic.fna последовательность ДНК (fasta)

GCF_003339765.1_Mmul_10_genomic.gbff аннотированный геном

GCF_003339765.1_Mmul_10_protein.faa последовательность белков (fasta)