На данной странице предоставлены результаты выполнения заданий второго занятия, посвященного поисковым системам. На этом занятии рассматриваются такие поисковые системы, как SRS, MRS и UniProt. SRS посвящены все задания, остальным же лишь первые два. Итак:

  1. Сравнение трех видов поисковых систем.

    Я не буду описывать ощущения на сайте, так как можно всё прочитать тут

  2. Эксперименты с запросами в полях поисковой системы SRS

    Эксперимент содержит в себе три части, завязанные на гамма-протеобактериях. Подробно ознакомиться с задачей вы можете здесь

    Результаты же можно прочесть тут: Протокол

  3. Исследование белка xynD_Bacsu в поисковой системе SRS
    Формулировка функции белка Строка запроса Количество найденных документов
    thereby assisting in arabinoxylan (AX) and short- chain arabinoxylo-oligosaccharide (AXOS) degradation
    		 ([swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria*] & ((([swissprot-Comment:Xylan*] & [swissprot-Comment:degradation*]) | [swissprot-Comment:Xylan degradation*]) > parent ))
    		1
    Cleaves arabinose units
    		 (([swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria*] & ([swissprot-Comment:Cleaves*] > parent )) & ([swissprot-Comment:units*] > parent ))
    		 39
    assisting in degradation
    		 ([swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria*] & ((([swissprot-Comment:Glycan*] & [swissprot-Comment:degradation*]) | [swissprot-Comment:Glycan degradation*]) > parent ))
    		 205
    Hydrolysis of terminal non-reducing alpha-L- arabinofuranoside residues in alpha-L-arabinosides
    		 ((((([swissprot-Comment:non-reducing*] & [swissprot-Comment:alpha-L-*]) & [swissprot-Comment:arabinofuranoside*]) | [swissprot-Comment:non-reducing alpha-L- arabinofuranoside* ]) > parent ) & [swissprot-Taxonomy:Gammaproteobacteria*])
    		1
     
    		  
    		  
  4. Сохранение данных в fasta-формате

    Собственно тут