Создание паттернов аминокислотных последовательностей
Выбранный участок отмечен звездочками, и его границы выделены цветом.
Характеристика паттерна
Паттерн
В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну?
Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены?
Фрагмент последовательности
L-I-F-G-H-Q-N-P-D-T-D-T-I-C
2
Нет
Сильный
[LFAY]-[VI]-[FI]-G-H-[KQL]-N-P-D-T-D-[ATS]-[IV]-[CAGS]
63
Да
Слабый
[VI]-[FIY]-G-H-[KQL]-N-P-D-T-D-x-[IV]-[CAGS]
Да
Все описанные в PROSITE мотивы в заданном белке XXXX_BACSU
Идентификатор документа PROSITE (AC)
Название мотива
Краткое описание мотива
Тип подписи (паттерн, профиль)
Паттерн (регулярное выражение)
Специфична ли подпись?
Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00008
MYRISTYL
Сайт N-миристоилирования
паттерн
G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P}
неспецифична
3
PS00005
PKC_PHOSPHO_SITE
Сайт Протеинкиназа С - фосфорилирования
паттерн
[ST]-x-[RK]
неспецифична
2
PS00006
CK2_PHOSPHO_SITE
Сайт казеинкиназа ll - фосфорилирования
паттерн
[ST]-x(2)-[DE]
неспецифична
3