Задание 9. Множественное выравнивание белка 1wpn_BACSU и его предполагаемых гомологов.

  
    1. В fasta-формате все выравнивание записано, но представить себе его трудно, потому что чтобы сравнить соответствующие
    позиции в разных последовательностях, приходится проматывать список. В формате msf соответствующие позиции стоят в столбик, 
    к тому же еще и раскрашены в зависимости от степени взаимозаменяемости аминокислот, стоящих в этой позиции.


    2. Участки с повышенной долей консервативных позиций: 



     

        
 
  
Столбцы выравнивания. 
        

        
         
 

         
 
  
Позиции моего белка.
        

 
        
         

         
     

     

        
  
  
4-27
        


        
         
 

         
 
 
  
0-23    

  
      

 

         
     
  

 

        
  
  
310-317
        


        
         
 

         
 
 
  
70-77   

  
      

 

         
     
 

 

        
  
  
330-344
        


        
         
 

         
 
 
  
90-104   

  
      

 

         
     
 

 

        
  
  
377-383
        


        
         
 

         
 
 
  
137-143    

  
      

 

         
     
  

 

        
  
  
385-396
        


        
         
 

         
 
  
145-156   

  
      

 

         
     
  

 
 



  Биологического смысла не несет выравнивание в позициях 429-558, так как исходный белок в нем уже не участвует.
Выравнивание в формате msf.