На главную
Постоение профиля пакетом Pftools
- Сначала программой pfw был расчитан вес строк выравнивания. В исходном файле каждая последовательность
имела вес 1, а на выходе веса были разные, в сумме они составляли единицу.
- Полученный профиль. Нормализация не проводилась.
-
Результаты работы профиля
Находок с весом не меньше 1 - 36081;
с весом не меньше 2 - 1709;
не меньше 3 - 812;
4 - 792;
5 - 756;
6 - 627;
7 - 420;
8 - 291.
9 - 149.
10 - 87.
Чувствительность паттерна из прошлого задания при селективности 95% - 60%, и чувствительность этого паттерна
при той же селективности - 60%. Таким образом, оба профиля примерно одинаковы по качеству.
Согласно ROC-кривой, оптимальный порог - 7,73. Чувствительность - 94%, селективность - 43%.
© Червонцева,2011