Гомологи белка

В 7 практикуме я выбрала белок ATP-dependent helicase из бактерии Lactobacillus amylovorus GRL1112, однако по нему не было ничего найдено с помощью BLAST, поэтому я буду использовать другой белок. tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA (AC: P25745)

При запуске BLAST были заданы следующие параметры:

Было выполнено множественное выравнивание первых 7 белков:

В выравнивании были оставленны все белки, поскольку было обнаружено, что аминокислоты полностью совпадают почти по всей длине выравнивания.

Гомологи зрелого вируса

Был выбран вирус:

ID: GP_PUUMS

AC: P27312

Название вируса: Puumala virus

Выбранный белок:

Название: Glycoprotein C

Координаты: 659-1148

Параметры при запуске BLAST:

Выполнено множественное выравнивание первых 5 белков