Практикум 9
Глобальное парное выравнивание гомологичных белков
Было проведено выравнивание и анализ его между мнемониками MNMA_, ACNA_, RAPA_.
| Protein Name | ID 1 | ID 2 | Score | % Identity | % Similarity | Gaps | Indels |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA | MNMA_ECOLI | MNMA_BACSU | 1047.0 | 53.8% | 68.8% | 23 | — |
| Aconitate hydratase A | ACNA_ECOLI | ACNA_BACSU | 2647.5 | 56.4% | 71.7% | 18 | — |
| Response regulator aspartate phosphatase A | RAPA_ECOLI | RAPA_BACSU | 43.0 | 9.7% | 15.4% | 736 | — |
Локальное парное выравнивание гомологичных белков
С этими же мнемониками было проведено парное локальное выравнивание.
| Protein Name | ID 1 | ID 2 | Score | % Identity | % Similarity | Gaps | Indels | Coverage 1 | Coverage 2 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA | MNMA_ECOLI | MNMA_BACSU | 1060.5 | 57.0% | 72.5% | 6 | |||
| Aconitate hydratase A | ACNA_ECOLI | ACNA_BACSU | 2647.5 | 56.6% | 71.9% | 16 | |||
| Response regulator aspartate phosphatase A | RAPA_ECOLI | RAPA_BACSU | 54.5 | 19.4% | 30.7% | 198 |