Учебный сайт Ивана Федорова


Практикум 3

Здесь рассматривается белок-рецептор эфрина EPHB4 (6FNI в базе данных PDB).

Bootstrap

Рис. 1. Общий вид.

Белок принадлежит человеку, состоит из одной ассиметрической единицы и представлен одной полипептидной цепью. Идентификатор в базе данных Uniprot - EPHB4_HUMAN.

Bootstrap

Рис. 2. Полимерная цепь.

Функция данного белка - проведение сигналов по соседним клеткам. Рецептор связывается с лигандами из семейства эфринов, расположенными на соседних клетках. Сигнальный путь от клетки с эфрином к клетке с рецептором называется прямым, а путь от клетки с рецептором к клетке с эфрином - обратным. Рецептор EPHB$ вместе с лигандом EFNB2 участвуют в регуляции адгезии и минрации клеток, а также играют ключевую роль в морфогенезе, ангиогенезе и восстановлении и обеспечении проницаемости сосудов. Сигналы, идущие по прямому пути, контролируют обособление от клеток, экспрессирующих EFNB2.

В белковой последовательности есть 3 мутации относительно записи в Uniprot. Кроме того, в основной цепи есть 2 модифицированных остатка аминокислоты серина.

Bootstrap

Рис. 3. DXH.

Кроме основной цепи, присутствует также одна малая молекула - DXH.