Рис. 1. Каталитический центр и его окружение.
В этом практикуме будет рассмотрено функционирование эфринового рецептора EPHB4.
ЕС номер этого фермента 2.7.10.1. Таким образом, он принадлежит к классу трансфераз, подклассу фосфотрансфераз и под-подклассу тирозин-киназ. Реакция, катализируемая им - присоединение фосфата из АТФ к остатку тирозина в белке: АТФ + Тирозил-полипептид = АДФ + Н+ + О-фосфотирозил-полипептид.
Каталитический центр состоит из одного аминокислотного остатка - аспартата ASP-740. Он вступает в связи с двумя расположенными рядом остатками - аргинином ARG-744 и аспарагином ASN-745.
Рис. 1. Каталитический центр и его окружение.
Рис. 2. Связи каталитического центра с другими остатками.
Ингибитор расположен на расстоянии 7,6 ангстремов от каталитического центра и не вступает с ним во взаимодействие. Вероятно, ингибирование является аллостерическим.
Рис. 3. Расстояние между ингибитором и каталитическим центром.
Рис. 4. Связь между белком и ингибитором.