Учебный сайт Ивана Федорова


Практикум 9

Таблица с парными выравниваниями.

Для множественного выравнивания я выбрал мнемонику ACCA, альфа-субъединицы ацетил-кофермента А карбоксилазы и карбоксил-трансферазы. Нашлось 465 белков, из них были отобраны ACCA_ARATH, ACCA_PEA, ACCA_ACIBT, ACCA_CHLPM, ACCA_BRASB. Ввравнивание было проведено с помощью Mafft.

Проект JalView.

На мой взгляд, все белки хорошо выровнялись, вероятно,они гомологичны; в них довольно много консервативных участков (например, 242-252), хотя встречаются и неконсервативные (384-401).