Упр.1.
A-форма ДНК. B-форма ДНК. Z-форма ДНК.
Упр.2.
Аденин 6: в сторону большой бороздки обращены атомы a6.c8, a6.n7, a6.c5, a6.c6, a6.n6; в сторону малой бороздки - атомы a6.c2 и a6.n3.
A-форма | B-форма | Z-форма | |
Тип спирали (правая или левая) | Правая | Правая | Левая |
Шаг спирали (Å) | 28.1 | 33.9 | 43.6 |
Число оснований на виток | 11 | 10 | 12 |
Ширина большой бороздки | 9.7(B/DT'27/P-A/DT'7/P) | 20.7(A/DA'10/P-B/DA'26/P) | 14.5(B/DG'37/P-A/DC'10/P) |
Ширина малой бороздки | 18.4(A/DA'18/P-B/DT'27/P) | 13.1(B/DC'36/P-A/DA'10/P) | 29.1(A/DC'10/P-B/DG'25/P) |
Упр.3.
Была проанализирована молекула тРНК 1tra.
Координаты стеблей: акцепторный стебель [1:7, 66:72]; D-стебель [10:25] антикодонный стебель [26:44]; Т-стебель [49-65].
Неканоничные взаимодействия: GU[4-69], TA[54-58], PG[55-18], AU[36-33], AC[38-32], PA[39-31], AG[44-26], AU[14-8], GC[15-48]
Дополнительные водородные связи третичной структуры: P55-G18, A14-U8, G15-C48, G19-C56.
Наибольшее перекрывание заметно у пар G18-P55 и U54-A58: