Практикум 12

AC PF00096
ID Zinc finger, C2H2 type
#SEED 159
#All 602k
#SW 2k
#architectures 28k
#3D 309
#eukaryota 594.5k
#archaea 585
#bacteria 300

Цинковый палец C2H2 - небольшой структурный мотив белка, который координирует ион цинка с помощью двух консервативных гистидинов и двух цистеинов. Он состоит из двух коротких бета-цепей, за которыми следует альфа-спираль. Аминоконцевая асть спирали связывается с большой бороздкой в ДНК-связывающих цинковых пальцах

Цинковый палец C2H2
Цинковый палец C2H2

Карта локального сходства

архитектура P18712
Архитектура белка P18712
архитектура P08153
Архитектура белка P08153
Информация
доменная архитектура 1 PF00096 - PF00096 - PF00096
Белок с архитектурой 1 P18712
доменная архитектура 2 PF00096 - PF00096
Белок с архитектурой 2 P08153

E-value: 3e-10

По карте локального сходства хорошо видно, что у одного белка исходная архитектура удвоена (P08153), а у другого - утроена (P18712). Это также подтверждается информацией о доменных архитектурах белка.

реакция CTP
Карта локального сходства