Был использован расширенный поиск, запрос: taxonomy [oc]: Phenylobacterium zucineum [284016] AND reviewed: yes. Среди аннотированных белков лучшим показателем был annotation score: 4. В выдаче был 201 белок, из списка которых выбран первый. Им оказался B4RBW5 · PYRG_PHEZH
Название: CTP-синтаза
В описании есть пункт Protein existence: Inferred from homology. Это свидетельствует о том, что существование белка было предсказано на основе гомологии с белками других организмов, но сам он получен не был.
Функция: белок является ферментом в биосинтезе пиримидинов. Он катализирует заключительный этап образования CTP (цитидинтрифосфат, необходим для синтеза РНК и ДНК). При этом он катализирует ATP-зависимое аминирование UTP в CTP, используя L-глутамин или аммиак в качестве источника азота.
В UniRef90 представлено только 18 белков, а в UniRef50 - 2641. Это может говорить о том, что хоть группа близкородственных белков и маленькая (UniRef90), белок всё равно древний и консервативный (UniRef50).
Запрос: (protein_name:"CTP synthase") AND (taxonomy_id:450851)
Был выведен один результат, что подтверждает, что в Phenylobacterium zucineum только одна синтаза
Запрос: (protein_name:"CTP synthase") NOT (taxonomy_id:468009)
taxonomy_id:468009 - организм Phenylobacterium zucineum. Был выведен 58971 результат, это говорит о том, что белок не уникален по функции.
Запрос (gene:pyrB OR gene:pyrC OR gene:pyrE OR gene:pyrF) AND taxonomy:"Phenylobacterium zucineum" не вывел никаких записей. Это может свидетельствовать о том, что рядом с геном pyrG нет других генов синтеза пиримидинов, что странно, поскольку обычно гены со сходными функции расположены рядом друг с другом. Это хорошо иллюстрируется на примере E. coli, у которой аналогичный запрос выдаёт три результата.