EBI Home Page
Image
Get   for     ? 
 Site search     ? 
EBI Home Page Image
Image
HOMOLOGY & SIMILARITY
Image
Image
Image Image Image Image
 Image Help
 Image General Help
 Image Formats
 Image Gaps
 Image Matrix
 Image References
 Image NCBI-Blast2 Help
   MView Help
   DBClustal Help
 
  Database Information

 UniProt
 UniParc
Image Image
 
  
 NCBI-Blast2   Summary Table
Image

SUBMISSION PARAMETERS
Title Sequence Database swissprot
Sequence length 326 Sequence type p
Program NCBI-blastp Version 2.2.2 [Dec-14-2001]
Matrix BLOSUM62 Gap extension penalty 1
Open gap penalty 10  


Alignment DB:ID Source Length Score Identity% Positives% E()
1  SW:RBSR_BACSU  Ribose operon repressor.  326  1643  100  100  e-165 
2  SW:RBSR_BACHD  Ribose operon repressor.  331  698  42  63  6e-66 
3  SW:RBSR_LACLA  Ribose operon repressor.  327  663  41  64  3e-62 
4  SW:REGA_CLOSA  HTH-type transcriptional regulator regA.  332  434  34  56  4e-38 
5  SW:SCRR_PEDPE  Sucrose operon repressor (Scr operon regulatory protein).  326  428  33  51  2e-37 
6  SW:CCPA_BACSU  Catabolite control protein A (Glucose-resistance amylase regulator).  334  426  31  51  3e-37 
7  SW:RBSR_PASMU  Ribose operon repressor.  337  404  30  51  6e-35 
8  SW:REGA_CLOAB  HTH-type transcriptional regulator regA.  334  391  33  52  1e-33 
9  SW:DEGA_BACSU  HTH-type transcriptional regulator degA (Degradation activator).  337  391  30  50  1e-33 
10  SW:SCRR_STRMU  Sucrose operon repressor (Scr operon regulatory protein).  320  390  33  53  2e-33 
11  SW:CCPA_STAXY  Probable catabolite control protein A.  329  389  32  49  2e-33 
12  SW:CCPA_BACME  Glucose-resistance amylase regulator (Catabolite control protein).  332  387  31  48  4e-33 
13  SW:CCPA_STAES  Probable catabolite control protein A.  329  378  32  48  3e-32 
14  SW:CCPA_STAEQ  Probable catabolite control protein A.  329  378  32  48  3e-32 
15  SW:CYTR_SHIFL  HTH-type transcriptional repressor cytR.  341  377  31  49  4e-32 
16  SW:CYTR_ECOLI  HTH-type transcriptional repressor cytR.  341  377  31  49  4e-32 
17  SW:CYTR_ECOL6  HTH-type transcriptional repressor cytR.  341  377  31  49  4e-32 
18  SW:CYTR_ECO57  HTH-type transcriptional repressor cytR.  341  377  31  49  4e-32 
19  SW:RBSR_SHIFL  Ribose operon repressor.  329  370  30  48  2e-31 
20  SW:RBSR_ECOLI  Ribose operon repressor.  329  370  30  48  2e-31 
21  SW:RBSR_ECOL6  Ribose operon repressor.  329  370  30  48  2e-31 
22  SW:RBSR_ECO57  Ribose operon repressor.  329  370  30  48  2e-31 
23  SW:RBSR_HAEIN  Ribose operon repressor.  331  367  31  48  5e-31 
24  SW:CCPA_STAAW  Probable catabolite control protein A.  329  362  30  48  2e-30 
25  SW:CCPA_STAAS  Probable catabolite control protein A.  329  362  30  48  2e-30 
26  SW:CCPA_STAAN  Probable catabolite control protein A.  329  362  30  48  2e-30 
27  SW:CCPA_STAAM  Probable catabolite control protein A.  329  362  30  48  2e-30 
28  SW:CCPA_STAAC  Probable catabolite control protein A.  329  362  30  48  2e-30 
29  SW:CCPA_STAAR  Probable catabolite control protein A.  329  359  30  49  3e-30 
30  SW:PURR_SHIFL  HTH-type transcriptional repressor purR (Purine nucleotide synthesis repressor).  340  358  30  48  4e-30 
31  SW:PURR_ECOLI  HTH-type transcriptional repressor purR (Purine nucleotide synthesis repressor).  340  358  30  48  4e-30 
32  SW:PURR_ECO57  HTH-type transcriptional repressor purR (Purine nucleotide synthesis repressor).  340  358  30  48  4e-30 
33  SW:PURR_SALTY  HTH-type transcriptional repressor purR (Purine nucleotide synthesis repressor).  340  357  29  47  5e-30 
34  SW:ENDR_PAEPO  Probable HTH-type transcriptional regulator endR.  340  356  29  51  7e-30 
35  SW:CCPA_STRMU  Probable catabolite control protein A.  333  355  32  52  9e-30 
36  SW:SACR_LACLA  Sucrose operon repressor (Scr operon regulatory protein).  318  353  31  51  1e-29 
37  SW:PURR_PASMU  HTH-type transcriptional repressor purR (Purine nucleotide synthesis repressor).  334  353  29  47  1e-29 
38  SW:PEPR_LACDL  HTH-type transcriptional regulator pepR1.  333  351  29  49  2e-29 
39  SW:PURR_HAEIN  HTH-type transcriptional repressor purR (Purine nucleotide synthesis repressor).  336  347  30  48  6e-29 
40  SW:GALR_SALTY  HTH-type transcriptional regulator galR (Galactose operon repressor).  342  341  30  48  3e-28 
41  SW:GALR_ECOLI  HTH-type transcriptional regulator galR (Galactose operon repressor).  343  340  29  48  3e-28 
42  SW:NTDR_BACSU  NTD biosynthesis operon regulator ntdR.  329  323  27  49  2e-26 
43  SW:REG1_STRLI  HTH-type transcriptional regulator reg1.  345  322  28  45  3e-26 
44  SW:KDGR_BACSU  HTH-type transcriptional regulator kdgR (Kdg operon repressor).  339  321  29  47  3e-26 
45  SW:GALR_HAEIN  HTH-type transcriptional regulator galR (Galactose operon repressor).  332  320  29  46  4e-26 
46  SW:MALR_STRCO  HTH-type transcriptional regulator malR (Maltose operon transcriptional repressor).  344  318  29  46  7e-26 
47  SW:Y4158_STRCO  Putative HTH-type transcriptional regulator SCO4158.  340  317  30  47  9e-26 
48  SW:CELR_THEFU  HTH-type transcriptional regulator celR.  340  312  29  46  3e-25 
49  SW:GALS_SALTY  HTH-type transcriptional regulator galS (Mgl repressor and galactose ultrainduction factor).  340  301  29  47  4e-24 
50  SW:YAML_STRLM  Putative HTH-type transcriptional regulator in aml 5'region (ORF-S1).  351  299  30  46  7e-24 
Image Image Image  
Image Image
 
Which EBI biological databases are available and how do I access them? EBI Site Map