- желтый :цепь A
- зеленый :цепь B
- оранжевый :цепь C
- красный :цепь D
load H:\Term1\Creditworks\Credit2\1gxp.pdb
script H:\Term1\Creditworks\Credit2\1gxp.def
restrict b and *.ca,m {1} background white {2}
center b,m select b
select b color blue
backbone 120 select cont_B_M
color yellow color green
select cont_B_M select weird
color green color gold
wireframe 100 select protatoms
select protatoms color cpk
color cpk cpk 300
cpk 300 select dnaatoms
select weird color cpk
color orange cpk 250
select m pause
backbone 100 картинка2
wireframe 60
select *c
color purple
select *d
color magenta
pause
картинка1
background black {3} restrict AA1,AA2,m {4}
select b select *c
backbone 20 backbone 90
select m wireframe 50
backbone 40 color purple
wireframe 20 select *d
select cont_B_M backbone 90
wireframe 100 wireframe 50
color [255,151,197] color magenta
select cont_B_M and (not 217a and not 223a) and *.n select dnaatoms
label %n%r cpk off
select weird select dna2
color gold color cpk
select AA1 cpk 250
color yellow pause
select 223a and *.o картинка4
label %n%r
select AA2
color green
select 217a and *.o
label %n%r
select dnaatoms
color cpk
cpk 250
center cont_B_M,dnaatoms
pause
картинка3
restrict cont_B_M,dnaatoms {5}
select cont_B_M
color gold
wireframe 100
select cont_B_M and (not 217a and not 223a) and *.n
label %n%r
set fontstroke 1
select protatoms
cpk 300
select AA1
color yellow
select AA2
color green
select dnaatoms
color cpk
cpk 250
select weird
color magenta
картинка5
Данный скрипт генерирует пять изображений:
1,2:Изображение зоны контакта цепи A с цепями C и D ДНК.
3,4:Изображение аминокислотных остатков цепи A,взаимодействующих с определенными атомами цепей C и D ДНК.
5:Изображение двух аминокислотных остатков,чья замена соответственно приведет или не приведет к изменению взаимодействия цепи A с ДНК.