На главную страницу второго семестра 

Информация о белке PHOB_ECOLI в базе данных Pfam


Доменная структура белка PHOB_ECOLI





N-концевой домен (зеленый)

C-концевой домен (красный)

  • Идентификатор Pfam: PF00072
  • Сокращенное название: Response_reg
  • Полное название : Сенсорный домен регулятора клеточного ответа
  • Положение домена в последовательности: 3-124
  • Изображение положения домена в 3D-структуре белка PHOB_ECOLI:


    • Идентификатор PDB: 1gxq


  • Идентификатор Pfam: PF00486
  • Сокращенное название: Trans_reg_C
  • Полное название : Транскрипциооный регулятор,C-конец
  • Положение домена в последовательности: 150-225
  • Изображение положения домена в 3D-структуре белка PHOB_ECOLI:





    • Идентификатор PDB: 1gxq



    Описание семейства доменов, к которому относится N-концевой домен белка PHOB_ECOLI


    Двухраздельные белки-регуляторы клеточного ответа участвуют в системе передачи двухкомпонентного сигнала в бактериях и в некоторых эукариотах, таких, как Protozoa. Функция этой системы состоит в детекции и ответе на изменения в окружающей среде. Такие системы были обнаружены среди других систем во время инвазии в тело хозяина, устойчивости к антибиотикам, движениях, усвоения фосфатов, осморегуляции и фиксации азота. Двухкомпонентная система состоит из гистидинпротеиназного сенсора, который фосфорилирует сенсорный домен в белке-регуляторе клеточного ответа. Фосфорилирование приводит к конформационному изменению в регуляторе клеточного ответа, который активирует эффекторный домен, вызывая клеточный ответ. Домены этих двухкомпонентных белков могут иметь разнообразное строение, но для них характерны основные структуры и функции, присущие этому типу белков.

    Регуляторы клеточного ответа исполняют роль активируемого путем фосфорилирования переключателя, который оказывает влияние на клеточный ответ, обычно путем транскрипционной регуляции. Большинство этих белков состоят из двух доменов: N-концового домена, получателя сигнала регулятора клеточного ответа, и вариабельного C-коцового эффекторного домена, который связывает ДНК. N-концевой домен белка PHOB_ECOLI принадлежит к семейству CheY и получает сигнал от сенсора, с которым он составляет описаную выше двухкомпонентную систему.

    Встречаемость белков с доменом PF00072


    Таксон
    Количество белков с доменом PF00072
    Эукариоты Растения 153
      Грибы 140
      Животные 4
    Бактерии   5049
    Археи   75


    Результаты просмотра доменной архитектуры PF00072

  • Всего известно 6537 белков с доменом PF00072.
  • В большенстве случаев домен PF00072 встречается в сочетании с другими доменами.
  • Известно не мало случаев дупликаци домена PF00072. Наблюдаются даже случаи, когда домен встречается в белке даже три раза (например, в белке RCAC_FREDI).
  • Наблюдаются перестановки таких доменов как HisKa, Hpt, GAF относительно домена PF00072 (обычно в присуствии других доменов).


    • © Глотова Ирина,2005