UniProt

Выбор белка

Поиск белков был выполнен по запросу: taxonomy_id:1618207 (идентификатор Psychromicrobium lacuslunae) Было получено 2887 результатов. Я выбрал белок CTP synthase, так как он хорошо аннотирован, относительно других белков P. lacuslunae

Информация о белке

Белок CTP synthase (ЦТФ-синтатаза) ктализирует АТФ-зависимую реакцию аминирования УТФ до ЦТФ с помощью L-глутамина или аммония в качестве источников азота Активность фермента регулируется другими рибонуклеотидтрифосфатами. Когда белок катализирует реакцию с глутамином, ГТФ выступает в роле аллостерического регулятора, стабилизирующего конформацию белка. ЦТФ-синтетаза участвует в метаболизме пиримидинов и в биосинтезе ЦТФ. Длина белка 575 а. о., а молекулярная масса 62378.

Поисковые запросы

  1. (protein_name:"CTP synthase") AND (existence:1) NOT (taxonomy_id:2759)

    2. По этому запросы му можем узнать у скольки прокариот существование ЦТФ-синтетазы доказано получением этого белка. Было получено 10 записей.

  2. (gene:pyrG) NOT (protein_name:"CTP synthase")

    В изначальной записи было сказано, что ЦТФ-синтетаза кодируется геном pyrG. Это ген также может кодировать другие белки у разных организмов, в большинстве случаев этот ген кодирует ОМФ-декарбоксилазу, который также принимает участие в метаболизме пиримидинов. Всего по результату запроса было получено 374 результата.

  3. (existence:1) AND (taxonomy_name:2) AND (cc_pathway:pyrimidine) NOT (protein_name:"CTP synthase")

    При поиске других ферментов, которые были получены экспериментально и которые участвуют в метаболизме пиримидинов у бактерий было найдено 7 записей. Это может говорить о плохой изученности этих метаболических путей у бактерий.