Cравнительный анализ канонической ДНК и стеблей тРНК

Задание 1

Задание 2

guanin
Рис. 1 Гуанин в В-форме ДНК. Красные атомы (с2, с4, n2, n3, n9) направлены в сторону большой бороздки, а синие (c5, c6, n7, o6) направлены к малой бороздке
А-форма B-форма Z-форма
Тип спирали правая правая левая
Шаг спирали (Å) 28.0 33.8 43.5
Число оснований на виток 11 10 12
Ширина большой бороздки 16.8 (B/C'32 - A/T'11) 17.2 (A/A'6 - B/C'32) 14.7 (A/C'8 - B/C'32)
Ширина малой бороздки 8.0 (A/T'11 - B/C'24) 11.7 (B/G'33 - A/C'12) 9.9 (B/G'33 - A/C'12)
Табл. 1 Сравнение различных форм дуплексов ДНК

Задание 3

С помощью пакета 3DNA была проанализирована структура 1n77. Одним из полученных файлов является 1N77.out, в котором содержиться следующая информация:

Координаты стеблей

(501-507 / 566-572) — акцепторный стебель

(549-553 / 561-565) — Т-стебель

(538-544 / 526-532) — антикодоновый стебель

(510-513 / 522-525) — D-стебель

Неканонические пары

502 G – 571 U (G-U)

554 U – 558 A (U-A)

555 U – 518 G (U-G)

538 A – 532 C (A-C)

544 A – 526 G (A-G)

513 U – 522 G (U-G)

508 U – 546 A (U-A)

514 A – 521 A (A-A)

515 G – 548 C (G-C)

Стабилизирующие пары

554 U – 558 A

555 U – 518 G

508 U – 546 A

514 A – 521 A

515 G – 548 C

519 G – 556 C