| UniProt AC | Q9KQG2 |
|---|---|
| UniProt ID | DHAS1_VIBCH |
| Рекомендуемое название белка | Aspartate-semialdehyde dehydrogenase 1 |
| RefSeq ID | NP_231670.1 |
| WP_001263690.1 | |
| PDB id | 1MB4 |
| 1MC4 | |
| 3PZR | |
| 3Q0E | |
| 4R5M | |
| Молярная масса, Да | 40498 |
| Длина белка, аа | 370 |
| UniRef100 | ID | UniRef100_Q9KQG2 |
|---|---|---|
| Размер кластера | 16 | |
| Другие сведения | ||
| UniRef90 | ID | UniRef90_Q9KQG2 |
| Размер кластера | 16 | |
| Другие сведения | Идентичен UniRef100. Видимо, говорит о сравнительной обособленности этой группы ферментов. | |
| UniRef50 | ID | UniRef50_Q9KQG2 |
| Размер кластера | 317 | |
| Другие сведения | В этом кластере есть два вхождения из метагеномов: из морские осадков и шахтных вод. |
| Запрос | Всего белков найдено | Из них Reviewed |
|---|---|---|
| name:"aspartate semialdehyde dehydrogenase 1" | 3 | 1 |
| name:"asa dehydrogenase 1" | 1 | 1 |
| name:"asadh 1" | 1 | 1 |
| name:"aspartate semialdehyde dehydrogenase 1" AND organism:"vibrio cholerae serotype o1 strain atcc 39315 el tor inaba n16961" | 1 | 1 |
| name:"aspartate semialdehyde dehydrogenase 1" AND taxonomy:vibrionaceae | 1 | 1 |
| name:histone | 131541 | 2083 |
| name:histone taxonomy:metazoa | 63788 | 1040 |
| name:histone taxonomy:ciliophora | 519 | 61 |
| name:trypsin | 18951 | 311 |
| name:trypsin name:inhibitor | 3914 | 210 |
Сравнение с форматом RefSeq
Запись RefSeq несет в себе значительно меньше подробностей. В ней также есть записи о имени белка, авторах, работах, на основании которых построена запись, Но в отличие от Uniprot указано положение гена в геноме организма.
История изменений
Uniprot позволяет просматривать всю историю изменений записи. Например, для данного белка существует более ста изменений. Во время последнего изменения в октябре 2017 года изменились только коментарии и ссылки на базы данных
- DT 07-JUN-2017, entry version 103. + DT 25-OCT-2017, entry version 104. … - CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms + CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms … - DR InterPro; IPR016040; NAD(P)-bd_dom. + DR InterPro; IPR036291; NAD(P)-bd_dom_sf. … - DR PANTHER; PTHR10174:SF194; PTHR10174:SF194; 1. + DR PANTHER; PTHR10174:SF116; PTHR10174:SF116; 1.
Отображение гликозилирования в Uniprot
Так выглядит одна из записей о гликозилировании в Glycoprotein 340 (UniProt AC: Q9UGM3). Присоединен N-ацетилглюкозамин к аспарагину 566. Тип доказательства (ECO): предположения куратора или проверенный вручную результат предсказаний программы.
FT CARBOHYD 566 566 N-linked (GlcNAc...) asparagine.
FT {ECO:0000255}.