KEGG PATHWAY
Для задания выбран путь метаболизма глутатиона.
Общие сведения о метаболическом пути глутатиона
Рисунок 1. Референсный путь метаболизма глутатиона (map00480). Зелеными точками показаны связаные пути.
Глутатион — трипептид, γ-глутамилцистеинилглицин. Соединение играет важную роль в жизни клетки, будучи антиоксидантом, оно определяет окислительно-восстановительные характеристики внутри клетки.
Активность глутатиона определяет во многом группа -SH цистеина. При окислении Глутатиона GSH переходит в димер GS-SG, который восcтанавливается глутатионредуктазой. Этот процесс отображен в левой части карты.
Верхняя часть карты показывает процессы переработки глутатиона. В нижней части сосредоточены процессы, в которых глутатион используется как основа для синтеза более длинных пептидов.
Конечными продуктами являются эти пептиды или продукты разборки глутатиона на аминокислоты.
Метаболизм GSH связан с путями метаболизма аминокислот: цистеина/метионина и таурина/гипотаурина (вход и вход/выход через L-Cysteine), аргинина (вход через L-Ornitine), цианоаминовой кислоты (выход через Glycine, синтез синильной кислоты), глутамата.
Метаболический путь в разных доменах жизни
Рисунок 2. Путь у бактерии (Escherichia coli K-12 MG1655).
Рисунок 3. Путь у археи (Methanococcoides burtonii).
Рисунок 4. Путь у эукариота (Mus musculus).
Видимо, путь существует в основном в эукариотах и бактериях. Поиск в Google Scholar показывает, что путь отсутствует во многих бактериях и археях. Так, у взятой археи путь, видимо отсутствует. Присутствуют лишь единичные реакции и белки, не связаные напрямую с глутатионом.
У эукариота и бактерии присутствующие белки образуют целые цепочки. Отсутствует только цепочки из модуля синтеза трипанотиона.
Реакция окисления трипантиона в базе данных KEGG
R03821На Рис. 1. Реакция выделена желтой точкой.
Рисунок 5. Реакция. Участники: Трипантион + Никотинамидадениндинуклеотидфосфат окисленный = Трипантион дисульфид + НАДФ восстановленный