Мини-обзор бактерии Corynebacterium ureicelerivorans

Авторство: Кузнецов Илья, студент первого курса Факультетa Биоинженерии и Биоинформатики

Аннотация

Изучение Corynebacterium ureicelerivorans, таксономии, общих качеств бактерии, ее генома, старт- и стоп-кодонов, характеристик белков и их видов, биографии бактерии.

Введение

До того как начать знакомство с Corynebacterium ureicelerivorans, нужно понять к каким таксономическим группам она принадлежит (таб 1). Поиск привел к тому, что бактерия принадлежит к типу Actinobacteria или Актиномицеты [2], данный тип характеризует спобность к формированию на некоторых стадиях развития ветвящегося мицелия [1]. Этот тип характеризует высокое содержания цитозина и гуанина. Класс Actinobacteria, подкласс Actibacteridae, отряд Actinomycetales, подотряд Corynebacterinae, семейство Corynebacteriaceae, род Corynebacterium. Впервые была извлечена из крови пациентов с подозрениями на септицемию. Corynebacterium ureicelerivorans липофильная, быстро разлагает мочевину, имеет близкое генетическое сходство с C. mucifaciens [3]. Была проведена работа по поиску информации о белках, геноме и общих свойствах бактерии, таких как: неподвижность, отсутствие спорообразования и грамм-положительность.

Материалы и методы

Для анализа генома бактерии данные были взяты с Генетической базы данных

Ресурсы Google Таблицы использовались для анализа количества белков различной длины, и систематики информации о каждом из белков

Для поиска систематических данных и описания морфологии использовался сайт:

Результаты

  1. Создана гистограмма зависимости количества белков от их длины
  2. Определены старт-кодоны генов и произведен их подсчет

Список Литературы

[1] Актиномицеты

[2] Nouioui I, Carro L, García-López M, Meier-Kolthoff JP, Woyke T, Kyrpides NC, Pukall R, Klenk H-P, Goodfellow M, Göker M. Genome-Based Taxonomic Classification of the Phylum Actinobacteria. Front. Microbio. 2018; 9:2007-2007.https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.02007 [ PubMed ]

[3] Yassin AF. Corynebacterium ureicelerivorans sp. nov., a lipophilic bacterium isolated from blood culture. Int J Syst Evol Microbiol 2007; 57:1200-1203. https://doi.org/10.1099/ijs.0.64832-0 [PubMed ]