Авторство: Кузнецов Илья, студент первого курса Факультетa Биоинженерии и Биоинформатики
Рассмотрение структуры
Структура представлена в виде белковой последовательности. Содержит одну единственную полимерную цепь. Так как цепь одна, то четвертичная структура молекулы представлена одной полимерной последовательностью.
Последовательность от N к C
Отдельные макромолекулы
Белок пренадлежит бактерии Hathewaya histolytica (ранее Clostridium histolyticum) обычно обнаруживается в фекали х и почве.
Из базы Uniprot был сопоставлен референс (Q9X721), относительно которого этот белок имеет три уникальные мутации на 575, 665 и 790 позициях относительно референса и на 200, 290 и 415 для самого белка соответсвенно. Название белка - Collagenase ColG.
Вторичные структуры
Малые молекулы
В белке встречается 4 малые молекулы не считая воду:
ITO ([6,7-bis(chloranyl)-3-phosphono-quinoxalin-2-yl]phosphonic acid)
Последний этап рассмотреть один из лигандов, на фотографии показано окружение, на растоянии 5 ангстрем, малой молекулы - 144.
144 ( tris-hydroxymethyl-methyl-ammonium)