Исследование белка 7ZBV

Авторство: Кузнецов Илья, студент первого курса Факультетa Биоинженерии и Биоинформатики

Рассмотрение структуры

Структура представлена в виде белковой последовательности. Содержит одну единственную полимерную цепь. Так как цепь одна, то четвертичная структура молекулы представлена одной полимерной последовательностью.

Последовательность от N к C

Отдельные макромолекулы

Белок пренадлежит бактерии Hathewaya histolytica (ранее Clostridium histolyticum) обычно обнаруживается в фекали х и почве. Из базы Uniprot был сопоставлен референс (Q9X721), относительно которого этот белок имеет три уникальные мутации на 575, 665 и 790 позициях относительно референса и на 200, 290 и 415 для самого белка соответсвенно. Название белка - Collagenase ColG.

Вторичные структуры

Малые молекулы

В белке встречается 4 малые молекулы не считая воду:

Выдержка из PDB-файла: Скачать полный PDB Format

Последний этап рассмотреть один из лигандов, на фотографии показано окружение, на растоянии 5 ангстрем, малой молекулы - 144.

144 ( tris-hydroxymethyl-methyl-ammonium)