Исследование белков бактерии Corynebacterium ureicelerivorans

Пользуясь ресурсами базы данных UniProt, поиск по названию бактерии дал 1842 результата. Рассмотрены были белки с качеством аннотации 4 и выше. Выбран был белок с несколькими функциями.

Информация о белке

Название белка - бифункциональный белок GlmU (Домены:Глюкозамин-1-фосфат N-ацетилтрансфераза и N-ацетилглюкозамин-1-фосфат уридилтрансфераза)

Кластеры похожих белков

Поиск запросов

  1. Поиск белков в протеоме, содержащих катион ртути
  2. Поисковый запрос (proteome:UP000028939) AND (keyword:KW-0476) выдал всего один результат: Alkylmercury lyase

  3. Поиск у Corynebacterium ureicelerivorans других белков с такими же функциями
  4. Поисковый запрос (taxonomy_id:401472) AND (ec:2.7.7.23) по базе данных UniProtKB также выдал всего один результат. Это значит, что Corynebacterium ureicelerivorans имеет только один белок выполняющий функции выбранного белка. Так как белок выполняет двойную функцию, то был произведен поиск по запросу:(taxonomy_id:401472) AND (ec:2.3.1.157). Результат был также однозначен.

  5. Поиск количества белков в роде Corynebacterium с определенной функцией, имеющих отличное от референса название
  6. Запрос: (taxonomy_id:1716) AND (ec:2.3.1.157) NOT (protein_name:"Bifunctional protein GlmU") выдал 4 результата:

    Все белки представлены у разных представителей, имеют различную длину, но выполняют одну функцию.