Protein Name | ID 1 | ID 2 | Score | % Identity | % Similarity | Gaps | Indels |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Multifunctional CCA protein (ECOLI); CCA-adding enzyme (BACSU) | CCA_ECOLI | CCA_BACSU | 213.5 | 22.6% | 37.5% | 27.5% | 22 |
N-acetylmuramic acid 6-phosphate etherase | MURQ_ECOLI | MURQ_BACSU | 736.0 | 46.4% | 65.1% | 2.0% | 1 |
Aminodeoxychorismate(/anthranilate(BACSU)) synthase component 2 | PABA_ECOLI | PABA_BACSU | 640.0 | 58.2% | 77.8% | 3.6% | 1 |
Protein name | ID 1 | ID 2 | Score | % Identity | % Similarity | Gaps | Indels | Coverage 1 | Coverage 2 |
Multifunctional CCA protein (ECOLI); CCA-adding enzyme (BACSU) | CCA_ECOLI | CCA_BACSU | 223.0 | 24.8% | 41.5% | 21.4% | 21 | 90.29% | 89.42% |
N-acetylmuramic acid 6-phosphate etherase | MURQ_ECOLI | MURQ_BACSU | 739.0 | 47.6% | 66.9% | 0.0% | 0 | 99.33% | 97.37% |
Aminodeoxychorismate(/anthranilate(BACSU)) synthase component 2 | PABA_ECOLI | PABA_BACSU | 641.0 | 61.1% | 81.6% | 0.0% | 0 | 98.93% | 95.36% |
Выравнивание | ID 1 | ID 2 | Score | % Identity | % Similarity | Gaps | Indels | Coverage 1 | Coverage 2 |
needle | ZNTA_ECOLI | CCA_ECOLI | 31.5 | 9.8% | 17.2% | 64.3% | 28 | - | - |
water | ZNTA_ECOLI | CCA_ECOLI | 45.0 | 19.9% | 31.8% | 26.2% | 14 | 36.34% | 70.87% |
Выравнивание в программах проводилось со стандартными параметрами:
Из значительно низкого веса, степени идентичности и схожести, а также большого количестве гэпов, можно сделать вывод о негомологичности исследуемых белков.
Мнемоника: MURQ_; Название белка: N-acetylmuramic acid 6-phosphate etherase; Нашлось 204 референсных белка;Выбранные белки приведены в выравнивании
Ссылка на проект. У всех белков есть ярко выраженные консервативные участки:
и другие.