Изначально для работы со сборкой планировалось взять морского ангела (Clione limacina). Однако поиск хотя бы какого-нибудь интерсного моллюска не выдал сборки, удовлетворяющей требованиям практикума. После долгих поисков, наконец, был найден организм, c Хромосомным уровнем сборки. К сожалению, это оказалась рыба... рыба-рука (Brachionichthys hirsutus). Это вид эндемик, обитающий в прибрежии вод Тасмании на глубине до 60 метров. Передвижение происходит по дну за счет грудных и брюшных плавников.
Информация по геномной сборке: 24 хромосомы, генетический набор - гаплоидный.
| Submitted GenBank assembly | GCF_040956055.1 |
| NCBI RefSeq assembly | GCA_040956055.1 (replaced) |
| Genome size | 406.6 Mb |
| Number of chromosomes | 24 |
| Number of scaffolds | 1,370 |
| Scaffold N50 | 13.5 Mb |
| Scaffold L50 | 13 |
| Number of contigs | 2,856 |
| Contig N50 | 416.6 kb |
| Contig L50 | 253 |
Предполагаю, что данная сборка в достаточной мере может отображать биологическую информацию, так как она имеет назкие параметры L50 на уровнях контигов и скаффолдов.
Для работы со сборкой были скачаны три файла:
