((PARGO,BRAPC),(LEPTH,BUGNE,LOXAA,(LUMTE,MYZSE),(MYTED,HETBL,(ALBCA,CEPNE))));
Как можем видеть, дерево построенное по таксономии имеет множество неразрешенных узлов, так как оно построено по видам беспозвоночных (информации по ним крайне мало) из-за чего программы построения деревьев в силу своих алгоритмов не смогут построить такие деревья. Однако посмотрим, какие деревья построены и какие множественные различия они имеют. Для начала внешнюю кладу (PARGO и BRAPC) разбило, как и (LUMTE и MYZSE), однако есть одна единственная клада, котороая сохранилась в обоих деревьях - (CEPNE и ALBCA). Однако и она не объединена ни с кем из тех, кто входил в изначальную кладу (HETBL, MYTED, (ALBCA, CEPNE)). Образовалась новая клада - (LOXAA,LUMTE).
Как и в предыдущем, внешнюю кладу разбило. Оттого укоренение происходило относительно одного и того же представителя. Как и в предыдущем дереве, ошибочно объединены (LUMTA, LOXAA). На этот раз HETBL, который изначально входил во внешнюю кладу, отделен от своего партнера (PARGO) двумя ветвями, а не тремя. Ошибочная клада - (LEPTH,MYZSE). Сохраненная клада - (ALBCA,CEPNE). Топология прошлого дерева схожа с новым, однако отношения ветвей преимущественно отличаются, но близкие группы можно выделить: (BRAPC,(LEPTH,MYZSE)).
Внешняя группа - разбита. Сохраненная клада - (ALBCA,CEPNE). Она же образует кладу, как в прошлом дереве: ((ALBCA,CEPNE),MYTED). Выраженная в прошлом дереве "близкая" группа на этом дереве представленна однозначно: (BRAPC,(LEPTH,MYZSE)). Общая топология сильно похожа на предыдущее дерево, но вот некоторые отличия: ((ALBCA, CEPNE), MYTED) изменилось на ((ALBCA, CEPNE), BRAPC); ((LOXAA,LUMTE),HETBL) изменилось на две отдельные ветви - (HETBL) и (LUMTE,LOXAA).