IMPERIAL

Выравнивание геномов




Выравнивание я делал по единственной хромосоме соответствующих организмов, AC которых искал с помощью новой версии сайта NCBI, выбирая уровень сборки не ниже хромосомного. Я решил посмотреть выравнивание геномов следующих прокариотических организмов Escherichia coli str. K-12 и Escherichia coli O157. у каждого организма по одной хромосоме.


Здесь должен был быть рисунок
Рис. 1 Выравнивание единственной хромосомы видов Escherichia coli str. K-12 (ось Х) и Escherichia coli O157 (ось Y) с помощью алгоритма blastn.


Здесь должен был быть рисунок
Рис. 2 Выравнивание единственной хромосомы видов Escherichia coli str. K-12 (ось Х) и Escherichia coli O157 (ось Y) с помощью алгоритма megablast.

Сразу видно отличное выравнивание геномов, которое наблюдается практически на всем участке