Краткое описание генома бактерии Atopobium parvulum
| Таблица 1. Классификация организма [1] |
| Надцарство |
Procaryota |
| Царство |
Bacteria |
| Тип |
Actinobacteria |
| Класс |
Actinobacteria |
| Отряд |
Coriobacteriales |
| Семейство |
Coriobacteriaceae |
| Род |
Atopobium |
| Вид |
Atopobium parvulum |
Atopobium parvulum относится к группе молочнокислых бактерий, которые обычно обитают в дыхательных путях человека, а также в десневой щели ротовой полости, поддерживая микрофлору. Эти организмы иногда изолируются в зубных абсцессах [2]. Все представитили рода Atopobium являются анаэробными бактериями, положительными по Граму [3]. Исследуемые организмы по форме - кокки, не способные двигаться, не образуют спор, не вызывают болезней (не паразитируют), но живут только внутри хозяина. Для них наиболее благоприятна мезофильная температура (около 37-45°C) [4].
Хромосома Atopobium parvulum представлена кольцевой молекулой ДНК, состоящей из 1543805 пар нуклеотидов. Дата секвенирования генома: 23 сентября 2009 года. Число белков: 1340 [5].
В таблице 2 вы можете узнать, сколько белков и какой длины кодируются в геноме бактерии.
| Таблица 2. Длины белков в хромосоме Atopobium parvulum |
| Промежуток |
Количество белков с длиной из данного промежутка |
| 1..100 |
103 |
| 101..200 |
268 |
| 201..300 |
318 |
| 301..400 |
264 |
| 401..500 |
179 |
| 501..600 |
81 |
| 601..700 |
47 |
| 701..800 |
32 |
| 801..900 |
23 |
| 901..1000 |
14 |
| >1000 |
24 |
Список использованных источников: