Главная cтраничкa сайта

Первый семестр

Второй семестр

Таблица. Измерение торсионнных углов остатка Tyr10 в белке YESX_BACSU, цепь А

Навание двугранного угла Угол определяется по координатам атомов Данный угол описывает поворот вокруг связи Результат измерения с помощью RasMol
φ
  1. Gly9:A.C (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)
  2. Tyr10:A.N (атом азота аминогруппы 10-го остатка цепи А)
  3. Tyr10:A.CA (альфа атом углерода 10-го остатка цепи А)
  4. Tyr10:A.C (карбонильный атом углерода 10-го остатка цепи А)
N10-Cα,10 -60.6
ψ
  1. Tyr10:A.N (атом азота аминогруппы 10-го остатка цепи А)
  2. Tyr10:A.CA (альфа атом углерода 10-го остатка цепи А)
  3. Tyr10:A.C (карбонильный атом углерода 10-го остатка цепи А)
  4. Leu11:A.N (атом азота аминогруппы 11-го остатка цепи А)
Cα,10-C10 130.2
ω
  1. Tyr10:A.CA (альфа атом углерода 10-го остатка цепи А)
  2. Tyr10:A.C (карбонильный атом углерода 10-го остатка цепи А)
  3. Leu11:A.N (атом азота аминогруппы 11-го остатка цепи А)
  4. Leu11:A.CA (альфа атом углерода 11-го остатка цепи А)
C10-N11 175.0


Торсионный угол


Карты Рамачандрана






Торсионные углы а.о. глицина принимают различные значения. Это объясняется тем, что глицин имеет маленький размер боковой группы, следовательно может находиться везде.



Торсионные углы пролина принимают значения, ограниченные в некотором промежутке. Можно также заметить, что угол φ принимает только отрицательные значения. Это объясняется циклическим строением молекулы пролина, и вследствии чего его плохой способностью к вращению вокруг связей.



Торсионные углы альфа-спиралей принимают в основном значения фи (-120;-45), что говорит о достаточно близком расположении альфа-спиралей.



Торсионные углы бета-тяжей принимают в основном значения в диапазоне (-170;-50) - углы фи, и (90;180) - углы пси, что говорит о том, что мне дан бета-белок.

Ссылка на Google

Kodomo


© Сергеева Ирина 2009