Исследование вторичной структуры белка YesX_Bacsu
1)Общее описание вторичной структуры белка YesX_Bacsu
В составе белка:
5 α-спиралей
61 β-тяжей
66 β-поворотов
Белок является β-белком
потому что в белке большое количество β-тяжей.
2)Элементы структуры, выбранные для дальнейшей работы
α-спираль: 568-575 а.о.
параллельный β-лист: 6-8 а.о. и 601-603 а.о.
антипараллельный β-лист: 59-62 а.о. и 23-27 а.о. и 16-20 а.о.
β-поворот: 338-342 а.о.
Cβ атомы расположены наружу от остова α-спирали.
3)Свойства выбранной α-спирали.
Водородные связи в α-спирали между атомами:
GLN575:a.N и ILE572:a.O
TRP574:a.N и LEU570:a.O
ALA573:a.N и ARG569:a.O
ILE572:a.N и TYR568:a.O
Для а.о. TRP574, ILE572 патерн водородных связей вычисляется по формуле Н(i,i+4)
Для а.о. GLN575, ALA573 патерн вычисляется по формуле H(i,i+3)
Cβ атомы расположены наружу от остова α-спирали.
4)Cвойства выбранного β-листа.
