Главная cтраничка сайта

Первый семестр

Второй семестр

Третий семестр

A- и В- формы ДНК. Структура РНК



Задание 1.


A-форма
A-форма (с торца)
B-форма
B-форма (с торца)
Z-форма
Z-форма (с торца)


Задание 2.

Упр.1

а) сахарофосфатный остов ДНК;
См. изображения a-формы , b-формы , z-формы
б) все нуклеотиды;
См. изображения a-формы , b-формы , z-формы
в) все аденины;
См. изображения a-формы , b-формы
г) атом N7 во всех гуанинах и/или только в первом по последовательности.
См. изображения a-формы , b-формы , z-формы
Скрипт лежит здесь

Упр.2

Проверка заданных структур ДНК и РНК на наличие разрывов.
Разрывов нет.
РНК
ДНК


Задание 3.

A-форма
В-форма
Z-форма


Рассматриваемое основание тимин.
A-форма ДНК (выбран тимин 15 цепи а):
- в малую борозду входят атомы O4, C4, C5, C5M, С6;
- в большую борозду входят атомы N3, O2, C2, N1.
B-форма ДНК (выбран тимин 31 цепи а):
- в большую борозду входят атомы O4, C4, C5, C5M, С6;
- в малую борозду входят атомы N3, O2, C2, N1.

  A-форма B-форма *Z-форма
Тип спирали (правая или левая) правая правая левая
Шаг спирали (Å) 28.03Å 33.75Å 32.92Å
Число оснований на виток 11 10 12
Ширина большой бороздки 16.49Å 17.21Å -
Ширина малой бороздки 7.98Å 11.49Å 7.20Å


  α (P-O5') β (O5'-C5') γ (C5'-C4') δ (C4'-C3') ε (C3'-O3') ξ (O3'-P) χ (C1'-N)
A-форма / презентация 64.08 / (-62) 174.80 / 173 41.67 / 52 79.14 / (88 или 83) -147.78 / 178 -40.70 / (-50) -157.23 / (-160)
В-форма / презентация 85.87 / (-63) 136.33 / 171 31.16 / 54 143.34 / (123 или 131) -140.78 / 155 83.70 / (-90) -98.03 / (-117)

акцепторный стебель состоит из участка 902-907 и комплементарного ему участка 966-971.
Т-стебель - из участка 949-953 и комплементарного ему участка 961-965;
D-стебель - из участка 910-912 и комплементарного ему участка 923-925;
антикодоновый стебель - из участка 926-933 и комплементарного ему участка 937-944;

© Сергеева Ирина 2009-2011