Для рассмотрения выбран фрагмент 118-130.
| Характеристика паттерна | Паттерн | В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? | Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены? |
| Фрагмент последовательности | Q-F-A(5)-G-R-F-G-S-G | 1 | Найден только мой белок |
| Сильный | [QEKA]-F-[ANKT]-[ADTK]-[AK]-[AG]-[TLA]-[AGTK]-R-F-G-S | 48 | Да |
| Слабый | F-x(2)-[AK]-[AG]-[TSLA]-X-R-F-G-S; | 70 | Да. Абсолютное большинство найденных белков выполнет ту же функцию, что и исходный. |
Все описанные в PROSITE мотивы белке SODM_BACSU
| Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
| PS00088 | SOD_MN | Manganese and iron superoxide dismutases signature | паттерн | D - x - [WF] - E - H - [STA] - [FY](2) D and H are manganese/iron ligands |
специфична | 1 |
| PS00001 | ASN_GLYCOSYLATION | N-glycosylation site | паттерн | N - {P} - [ST] - {P} N is the glycosylation site | неспецифична | 1 |
| PS00006 | CK2_PHOSPHO_SITE | Casein kinase II phosphorylation site | паттерн | [ST] - x(2) - [DE] [S or T is the phosphorylation site] | неспецифична | 2 |
| PS00008 | MYRISTYL | N-myristoylation site | паттерн | G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P} [G is the N - myristoylation site] | неспецифична | 4 |
©Умарова, 2009