На главную страницу

Измерение торсионных углов

Таблица. Измерение торсионных углов остатка TYR10 в белке SODM_BACSU, цепь А

Название
двугранного
угла 		Угол определяется по координатам атомов
(обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol,
в скобках - название атома) 		Данный угол описывает
поворот вокруг связи 		Результат измерения
с помощью RasMol
φ
  1. PRO9:A.C
  2. TYR10:A.N
  3. TYR 10:A.CA
  4. TYR 10:A.C

N10 - C&alpha10 -153,1
ψ
  1. TYR10:A.N
  2. TYR10:A.CA
  3. TYR10:A.C
  4. ALA11:A.N
C&alpha10 - C10 175.5
ω
  1. TYR10:A.CA
  2. TYR10:A.C
  3. ALA11:A.N
  4. ALA11:A.CA
C10 - N11 179.9


Все остатки цепи А и остатки глицина цепи А

Все остатки цепи А, спирали и листы

Можно заметить, что лучше всего сгруппированы остатки, принадлежащие вторичным структурам. Для бета-листов характерны значения угла пси от 110 до 180. Для спиралей - небольшие отрицательные значения. Углы фи, характерные для спиралей и листов - (-50)-(-150).














©Умарова, 2009