Исследование вторичной структуры белка.

Главная

Количество водородных связей: 139

Количество альфа-спиралей: 5

Количество бета-складок: 28

Количество бета-поворотов: 24

Данный белок относится к α+β-белкам, так как в нем присутствуют α и β элементы вторичной структуры, и они не чередуются.

Для исследования выбраны элементы вторичной структуры:

α-спираль: 15-20

Антипараллельные β-тяжи: 60-70, 73-83

β-поворот: 71-72

Параллельные β-тяжи: 158-165, 168-173, 176-181

α-спираль:

Паттерн H-связей для α-спирали: H(i,i+2)

Атомы Cβ располагаются по внешней стороне спирали.

β-тяжи:

Атомы Cβ располагаются по обе стороны от плоскости β-листа. В каждом β-тяже чередуется расположение Cβ-атомов по нижнюю и по верхнюю сторону листа.

β-поворот:

Аминокислоты, образующие β-поворот: Glu70Gln71Pro72Gly73.

В данном β-повороте нет H-связи, способной скрепить поворот.


©Гущина Ирина