Выравнивание получено программой muscle (muscle -in delta.fasta -out delta.afa), и отредактировано в GeneDoc. Красным цветом помечены столбцы с процентом консервативных остатков 100%, оранжевым - 80%, желтым - 60%. Цифры сверху выравнивания означают номера столбцов, справа - номера последних остатков каждой последовательности, снизу - функционально консервативные позиции. Также снизу отмечены большими буквами консервативные остатки, малыми - консервативные остатки в столбцах, где их процент от 80% до 100%. Звездочки сверху показывают каждый десятый столбец, не отмеченный числом сверху.
В Swiss-Prot гомологов с E-value меньше 0.001 и процентом идентичности меньше 90% найдено не было, поэтому BLAST был запущен по "nr".
Участки с повышенной долей консервативных позиций: в 124-195 столбцах (48-117 остатки YESU_BACSU), в 205-231 столбцах (124-149 остатки YESU_BACSU), в 254-297 столбцах (171-214 остатки YESU_BACSU).
Участки, где выравнивание не имеет биологического смысла: в 1-26 столбцах, в 61-117 столбцах, в 232-238 столбцах, в 282-284 столбцах.
Группы аминокислот, образующие функционально консервативные позиции: DN, EQ, ST, KR, FYW, LIVM. Чаще всего встречается группа LIVM. При добавлении группы DE появляются новые функционально консервативные позиции.