В поисковой системе MRS запись имеет наиболее дружественный вид и представляет собой адаптированную краткую запись UniProt. Поле FT не содержит графического представления вторичной структуры белка, а только таблицу, такую же, как и в краткой записи UniProt. Зато при щелчке по строке этой таблицы выделяется участок последовательности в формате fasta, расположенной ниже на этой же странице.
В поисковой системе SRS запись имеет примерно то же строение, что и в MRS. Поле FT кроме таблицы содержит графическую схему вторичного строения белка. При нажатии на участок схемы или на сторку таблицы участок fasta-последовательности отображается в отдельном окне.
В поисковой системе UniProt запись имеет наименее дружественный вид, так как больше всего отличается от струтуры краткой записи UniProt. В поле FT таблица появляется только после нажатия кнопки Details. В каждой строчке таблицы имеется графическое представление участка белка. При нажатии на него последовательность аминокислот появляется в отдельном окне. Полная последовательность белка имеет не fasta-формат.
Число записей, описывающих белки из рода Bacillus: 23013.
Число записей, описывающих белки из отдела Firmicutes: 67277.
| Формулировка функции белка | Строка запроса | Количество найденных документов |
|---|---|---|
| uncharacterized protein | (([swissprot-Taxonomy:Firmicutes*] & [swissprot-Description:uncharacterized*]) & [swissprot-Description:protein*]) | 1649 |
Найденные последовательности в fasta-формате.
Число записей в файле с белками Bacillus subtilis: 86894.
Запрос: grep -c ID /P/y10/Term_2/Block1/Practice3/bacsu.gbk