Работа с банком UniProt.

Главная

Информация банка UniProt о белке yesU_BACSU:

 Метка поляСодержание
Код доступа AC O31524
Идентификатор записи в БД ID YESU_BACSU
Название (краткое описание) белка DE Uncharacterized protein yesU (белок неизвестной функции)
Дата создания документа DT 01-JAN-1998
Дата последнего исправления аннотации DT 30-NOV-2010
Число публикаций, использованных при создании документа RN 2
Журнал и год самой поздней публикации RL В 2005 году помещен в базу данных PDB
Ключевые слова KW 3d-structure; complete proteome
Что содержит поле комментариев? CC Информацию об авторских правах
Идентификаторы записей PDB DR 1oq1

В состав первой альфа-спирали, аннотированной в описании структуры белка входят аминокислоты с 16-ой по 19-ую (KSDV).

Число белков, имеющих примерно такое же описание, что и yesU_BACSU:

Запрос Число записей в SwissProt Число записей в TrEMBL
"Uncharacterized protein" 14547 3932802
"Uncharacterized protein yesU" 1 2
Uncharacterized protein 17768 3930640

Сравнение записи белка yesU_BACSU с записью белка с похожим описанием:

  Метка поля YESU_BACSU CD003_HUMAN
Первый код доступа AC O31524 Q8WVX3
Идентификатор последовательности в БД ID YESU_BACSU CD003_HUMAN
Название (краткое описание) белка DE Uncharacterized protein yesU (белок неизвестной функции) Uncharacterized protein C4orf3 (Hepatitis C virus F protein-transactivated protein 1; HCV F-transactivated protein 1)
Дата создания документа DT 01-JAN-1998 18-MAR-2008
Дата последнего исправления аннотации DT 30-NOV-2010 08-FEB-2011
Название организма OS Bacillus subtilis Homo sapiens (человек)
Классификация организма (список таксонов) OC Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus. Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo.
Длина последовательности ID 220 66
Молекулярная масса белка SQ 25203 7604
Число публикаций, использованных при создании документа RN 2 3
Журнал и год самой поздней публикации RL В 2005 году помещен в базу данных PDB Genome Res., 2004
Описание вторичной структуры FT
STRAND211
HELIX1619
STRAND2331
HELIX3335
STRAND3643
STRAND4851
STRAND5870
STRAND7283
HELIX102105
STRAND106121
HELIX122125
STRAND129135
TURN136138
STRAND139145
HELIX151153
STRAND158165
STRAND168173
STRAND176182
STRAND185190
STRAND194202
STRAND206219
1 цепь, TRANSMEM: 45-65 Helical; (Potential).
Ключевые слова KW 3d-structure; complete proteome. Alternative splicing; Complete proteome; Membrane; Polymorphism; Transmembrane; Transmembrane helix.
Темы, освещённые в комментариях CC Информация об авторских правах. Информация о расположении белка в клетке, о белах, которые могут его заменить, об авторских правах.
Особенности последовательности FT нет Варьирует 17-ая (R и Q) и 32-ая (P и H) аминокислоты; 1-ая аминокислота (M) может быть заменена на последовательность аминокислот.
Идентификаторы записей PDB DR 1OQ1 нет

Удобная, краткая и информативная форма записи о белках в банке UniProt позволяет эффективно сравнивать различные белки между собой.

©Гущина Ирина