Понятие о выравнивании.

Главная

Выравнивание двух аминокислотных последовательностей вручную с помощью программы GeneDoc:

Процент идентичности последовательностей: 66.67% (14/21).

Процент сходства последовательностей, определенный с помощью таблицы BLOSUM62: 71.43% (15/21).

Данная последовательность seq1 является фрагментом белка YESU_BACSU, ее координаты: 160-179.

Произведено выравнивание белка YESU_BACSU из Bacillus subtilis и C6Y1P1_PEDHD, предполагаемого белка с неизвестной функцией (putative uncharacterized protein).

Процент идентичности: 28% (48/174), процент сходства: 42% (73/174), число гэпов: 9% (16/174).

Координаты выровненного участка: 48-219 у YESU_BACSU и 124-283 у C6Y1P1_PEDHD.

Карта локального сходства:

©Гущина Ирина