| seq1 | M | K | L | I | K | D | K | G | Y | - | V | H | F | S | I | N | G | L | P | I | L |
| seq2 | M | K | P | I | K | D | K | G | Y | S | V | H | N | M | I | N | G | V | E | P | L |
| Вес | 5 | 5 | -3 | 4 | 5 | 6 | 5 | 6 | 7 | -12 | 4 | 8 | -3 | -1 | 4 | 6 | 6 | 1 | -1 | -3 | 4 |
Bес выравнивания: 53.
Выравнивание, полученное с помощью программы stretcher совпало с построенным вручную, также совпал подсчитанный и выданный программой вес выравнивания.
В частичное выравнивание вошли участки 7-216 (для YESU_BACSU) и 29-280 (для C6Y1P1_PEDHD).
Локальное выравнивание совпадает с участком глобального выравнивания.
Частичное выравнивание имеет больший вес (161), чем полное (152). Вес оптимального глобального выравнивания не может быть больше веса оптимального локального выравнивания, так как при исключении несходных участков в начале и в конце последовательностей увеличивается процент идентичности и сходства.