EMBOSS: пакет программ для анализа последовательностей

Для данного практикума необходимо написать скрипт на python и/или bash, решающий опреределённую задачу. Мной была выбрана 4 задача:

По данному аннотированному файлу в формате gb (из GenBank или RefSeq) или embl (из ENA) создать файл с кодирующими последовательностями в формате fasta, добавив в описание каждой последовательности функцию белка (из поля product).

Файл скрипта

Для проверки скрипта был использован GenBank файл.
На выходе был получен fasta-файл.

Назад

Главная страница