Cхема из Pfam: |
|||||
№ | Pfam AC | Pfam ID | Полное название семейства домена | Положение в последовательности | Клан |
1 | PF02837 | Glyco_hydro_2_N | Семейство 2 гликозил гидролаз, домен связывания сахаров Семейство включает β-галактозидазную, β-маннозидазную и β-глюкуронидазную активности |
49-219 | Клан GBD (CL0202), содержащий 25 семейств |
2 | PF00703 | Glyco_hydro_2 | Семейство 2 гликозил гидролаз, иммуноглобулин-подобный β-сендвичевый домен Семейство включает β-галактозидазную, β-маннозидазную и β-глюкуронидазную активности |
221-334 | - |
3 | PF02836 | Glyco_hydro_2_С | Семейство 2 гликозил гидролаз, домен TIM_barrel (триозофосфатизомеразный бочонок) Семейство включает β-галактозидазную, β-маннозидазную и β-глюкуронидазную активности |
336-630 | Клан Glyco_hydro_tim (CL0058), содержащий 30 семейств |
4 | PF02929 | Bgal_small_N | Малая цепь β-галактозидазы (обычно димерной β-галактозидазы EC:3.2.1.23, однако домен встречается и в одноцепочечных ферментах) | 749-1022 | Клан Gal_mutarotase (CL0103), содержащий 5 семейств |
Таксон | Количество белков с доменом | ||||
PF02837 | PF00703 | PF02836 | PF02929 | ||
Всего видов | 433 | 404 | 410 | 229 | |
Эукариоты | Зеленые растения | 57 | 34 | 36 | 17 |
Грибы | 160 | 168 | 97 | 34 | |
Животные | 94 | 56 | 96 | 0 | |
Остальные эукариоты | 18 | 14 | 14 | 2 | |
Бактерии | 2086 | 1804 | 1798 | 677 | |
Археи | 16 | 15 | 13 | 1 |
№ | PFAM ID | Количество белков в Escherichia coli (strain K12) |
1 | PF02837 | 4 |
2 | PF00703 | 4 |
3 | PF02836 | 4 |
4 | PF02929 | 3 |
Пример исчезновения домена PF00703
Пример укорочения домена PF02837
Домен PF02929 перестает быть C-концевым
Домен PF02929 разрывается
2010 ©