Торсионные углы φ и ψ

Точечная диаграмма зависимости торсионных углов φ и ψ, в которой по оси абсцисс откладывается φ, а по оси ординат - ψ, и углы меняются от -180º до 180º, называется картой Рамачандрана. Ниже приведены карты Рамачандрана для всего белка yecd и для α-спирали (остатки 40-58 цепи А).

Точки, "выпадающие" из общего скопления – это точки со значениями φ для 40-ого и ψ для 58-ого остатков. Эти углы характеризуют не взаимное расположение атомов внутри α-спирали, а расположение пограничных атомов, относительно соседних с α-спиралью остатков.
Из диаграммы видно, что остатки в составе α-спирали имеют значения –80º≤φ≤–50º и –50º≤ψ≤–20º

На диаграмме для белка ясно выделяются два скопления точек: одно из них соответствует α-спирали(нижнее), а второе(верхнее)– β-слою. Точки, не лежащие в этих скоплениях отвечают, как правило, глицину. Значения его торсионных углов могут меняться сильнее, чем у остальных аминокислот, так как у него нет Сβ атома. На карте Рамачандрана для цепи А белка хорошо заметно, что точки с φ≥60º чаще всего отвечают глицину:

2008 ^©