Практикум №1

На главную На страницу второго семестра

— — — — — — — —

Скачать скрипт

Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре

#	Имена атомов	Длина связи (А)	Угол N-H-O (градусы)
Альфа-спирали
1	N(154LEU)-O(150VAL)	2.88	163.6
2	N(151LEU)-O(147ALA)	2.95	163.5
3	N(158ALA)-O(154LEU)	2.81	154.7
Бета-тяжи
1	N(37ILE)-O(126PHE)	2.97	166.9
2	N(124SER)-O(39PHE)	3.23	154.6
3	N(39PHE)-O(124SER)	2.7	168.8

Как видно из данных в таблице, длина связи колеблется от 2.7 до 3.23 А, а угол от 154.6 до 168.8 градусов, что хорошо согласуется с теоретическими данными.

Источники:

1. Основы биохимии Ленинджера: в 3т. Т.1: Строение и катализ / Д. Нельсон, М. Кокс
2. https://en.wikipedia.org/wiki/Protein_secondary_structure
3. https://en.wikipedia.org/wiki/Alpha_helix
4. https://en.wikipedia.org/wiki/Beta_sheet