Практикум №6

На главную На страницу третьего семестра

— — — — — — — —

Задание №1

Скачать консенсусную последовательность

Скачать итоговое выравнивание

*Здесь должна быть картинка с проблемным участком*
Здесь видно, что на данный нуклеотид приходится два разных пика, так что только по этой хроматограмме не очень ясно, что там стоит на самом деле. Однако нулеотид быстро восстанавливается по обратной последовательности.

*Здесь должна быть картинка с проблемыми участками*
Здесь аналогичная ситуация.

*Здесь должна быть картинка с проблемыми участками*
Здесь аналогичная ситуация.

Границы нечитаемых участков: прямая цепь (5' – 1-25, 3' – 713-719), обратная цепь (5' – 1-34, 3' – 720-721). В целом хроматограммы очень хорошие, так как уровень шума низкий, а почти все непрочитанные нуклеотиды можно восстановить по обратной цепи. Если не учитывать концевые участки, то соотношение шума к сигналу примерно 1:50, и он равномерно распределён по псоледовательности.

Скачать прямую цепь

Скачать обратную цепь

Задание №2

*Здесь должна быть картинка с плохим участком хроматограммы*
Это плохой участок хроматограммы, так как тут невозможно определить нуклеотиды, виден лишь сплошной шум.