На главную На страницу четвёртого семестра
— — — — — — — —
Выбранный белок – Mitochondrial ADP-ATP carrier, conformation 1 (4c9g).
Этот белок импортирует АДФ из цитоплазмы и экспортирует АТФ из матрикса митохондрий. Механизм циркуляции пока остаётся не выясненным до конца. Белок имеет три домена, которые удерживаются вместе за счёт трёх междоменных солевых мостика, состоящих из глутаминовых остатков. Они ответственны за обеспечение энергетического барьера, который удерживает белок от смены конформации, пока не произошло взаимодействие с субстратом. С цитоплазматической стороны образуется вторая сеть солевых мостиков во время транспортировки. Анализ доменных структур и свойств междоменных частей показывает, что смена конформаций связана со сменой положения чётных альфа-спиралей вдоль нечётных из-за вращения доменов. Нечётные альфа-спирали имеют L-форму с сериновыми остатками в узле сгиба в роли рычагов. Они играют важную роль в перестройке сетей солевых мостиков во время связывания субстрата. Одновременное движение трёх доменов вокруг центрального проводящего пути является уникальном механизмом для транспортных белков. [1]
Я выбрал этот белок, так как он связан с митохондриями дрожжей, с чем я много работал в рамках курсовой работы в этом году.
Результат работы сервиса TMHMM:
Как мы можем видеть, в данном белке присутствует три внутримембранных части. Это хорошо согласуется с общей информацией из статьи, так как в нём присутствуют три домена внутри мембраны. Каждый домен имеет очень хорошие показатели на графике, все данные согласуются отлично.
Визуализация белка в мембране при помощи сервиса OPM:
