На главную На страницу четвёртого семестра
— — — — — — — —
Задание №1
Выбранный вирус – BtNv-AlphaCoV/SC2013. Upstream области его генома были вырезанны и помещены в отдельный файл.
Задание №2
Мотивы были найдены при помощи команды на сервере kodomo: meme upstream.fasta -dna -nmotifs 3 -minw 6. Наилучший мотив:
Несмотря на малое информационное содержание нуклеотидов в некоторых позициях, это мотив с наименьшим значением E-value, а также он единственный встречается во всех последовательностях.
Задание №3
В данной в условии статье приведена последовательность TRS: CUUUAGA. При первом поиске найти что-то похожее не удалось. При расширении поиска до 10 вариантов была найдена похожая последовательность, однако лишь два участка содержат её, а также она имеет слишком большой E-value:
