Описание Бета-глюканазы из генома бактерии Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85.
Информация о белке
Мной был изучен белок Бета-глюканаза из генома бактерии Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85. С помощью сайта NCBI были получены данные о белке и его гене. Эти данные приведены в таблице 1.
| Идентификатор белка | ADL24776.1 |
|---|---|
| Идентификатор генома | CP002158.1 |
| Название белка | Beta-glucanase |
| Координаты гена в геноме | 256765..257814 |
| Длина гена (п.н.) | 1050 |
| Цепь | Прямая |
| Длина белка (а.о.) | 349 |
Для получения последовательности белка, был произведен поиск в базе данных NCBI по типу данных Protein. Она была скопирована в файл в формате FASTA.
Бета-глюканаза является ферментом, расщепляющим бета-глюканы до низкомолекулярных соединений, таких как изомальтоза и мальтотриоза.
Геномное окружение гена белка
Мной был изучен ген кодирующий данный белок с помощью базы данных NCBI, а именно был совершен поиск по типу Nucleotide и найден нужный ген по его координатам в Graphics. Геномное окружение гена данного белка приведено на рисунке 1.
Красные полоски обозначают различные гены, белые стрелки на них - направление считывания. В верхней части находятся рамки считывания, обозначенные от -3 до 3. В них зеленые полоски - старт-кодоны, красные - стоп-кодоны. Данный ген находятся в окружение генов ADL25115.1 и ADL27239.1.